金管會今年7月1日起將由現行的委員制改為首長制，隸屬行政院管轄，面對外界質疑金融監理機關改為首長制，如何防堵類似前朝政府把手伸進金融改革的疑慮，金管會主委陳裕璋表示，即使是首長制，對於個案的核准和處分，金管會仍保有獨立行使職權。
行政院組織法修正之後，今年7月1日起，金管會由獨立機關改為首長制機關，引發外界對金管會超然獨立的質疑。陳裕璋表示，行政院討論組織法時確定金管會不再是獨立機構，由於非獨立機關很少有委員制的，因此7月1日起金管會不再是委員制，將改為首長制。
陳裕璋表示，委員制和首長制各有其優點，參考國際實際狀況，金融主管機關很少是真正的獨立機關，因為金融政策是國家政策很重要一部分，且各國普遍認為應變金融環境變遷，首長制的反應會比較快，快速的應變反應正好是目前金融環境變遷下需要的。
但陳裕璋強調，未來金管會在金融監理一定是獨立行使，但在政策發展上則仍是國家重要的一部份，也就是牽涉個案的部分，金管會還是會獨立行使職權，例如個案的處分或核准，即使是7月1日以後，也仍然由金管會獨立行使職權。
